Genomic quantification of inbreeding depression in wild vertebrate populations
本研究对来自20个野生脊椎动物种群的91个效应量进行了全球元分析,证实了基因组近交会显著降低适应度(尤其是对雄性而言),并表明这些代价在不同生命阶段、性状类型和保护状态下均保持一致。
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进化生物学探索生命如何随时间变化与适应,揭示从微小基因变异到复杂物种形成的奇妙旅程。在这里,我们关注生命之树的生长脉络,解读自然选择如何塑造地球上纷繁多样的生物形态。
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本研究对来自20个野生脊椎动物种群的91个效应量进行了全球元分析,证实了基因组近交会显著降低适应度(尤其是对雄性而言),并表明这些代价在不同生命阶段、性状类型和保护状态下均保持一致。
这项研究揭示了蜘蛛毒腺是如何通过三个祖先程序的层级化共选演化为发育嵌合体的:即一个用于建立空间坐标的附肢模式形成基因(*Distal-less*)、一个通过抑制潜在神经程序以维持分泌身份的转录因子(*sage*),以及一个驱动肌肉介导的代谢支持的肌源性因子(*sum-1*),从而阐明了复杂器官是如何通过整合不同的组织模块而产生的。
这项研究表明,在野生和栽培苹果中,由强烈的纯化选择所驱动的保守转录可塑性构成了应对气候变化的主要分子响应,而局部适应则依赖于独特的、具有群体特异性的位点,并发挥次要作用。
本研究通过演化博弈论建模证明,个体异质性与涌现式领导力之间的相互作用显著促进了群体中合作的演化,特别是在极少数个体作为领导者并根据其强度或角色采取条件策略的情况下。
通过对145个跳虫分类单元的1,127个单拷贝直系同源基因进行全面的系统发育基因组学分析,本研究通过识别导致持续系统发育不一致的早泥盆世时期的一次古老的快速辐射演化,解决了跳虫系统发育中长期存在的冲突,并最终支持原尾目(Poduromorpha)是现存四个目中最早分化的谱系。
这项研究揭示了在软骨鱼类中,LPS激活的caspase-1将祖先GSDMA/B蛋白切割成具有拮抗性的片段(N241和N288),从而驱动一种具有固有杀菌活性的非典型焦亡途径,进而阐明了GSDMA-D谱系的进化起源及其双片段调节机制。
本文介绍了一种名为“适应度通量”(fitness flux)的直接基于频率的方法来衡量病毒适应性,揭示了 SARS-CoV-2 最初经历了快速适应后趋于放缓,而流感 H3N2 则保持了较为稳定的步伐,且两种病毒的适应度增益均与费舍尔的基本定理相一致,并主要由刺突蛋白受体结合域的突变所驱动。
本文介绍了一种基于同质性的可扩展方法,该方法利用 Cas9 诱导突变的不可修饰性来有效评估推断的细胞谱系树的可靠性,证明了在没有基准真相的情况下,其在区分准确重建方面的性能优于传统的简约得分。
本文引入了一种适用于稀疏数据集的新型基于图的崎岖度度量方法,揭示了蛋白质适应度景观呈现出局部复杂性,即主导生物物理约束(如折叠和结合)发生转变。
本研究展示了首个黑翅蕈蚊雄性生殖系染色体级基因组组装,揭示了其生殖系限制性染色体尽管富含基因且处于强烈的净化选择之下,仍表现出非凡的结构与内容动态性,同时也为卫星DNA介导的体细胞消除提供了证据。